Սանահինի վանական համալիրի Գրիգոր Մագիստրոս ճեմարանի պատերից յուրաքանյուր անձրեւից հետո կաթում է:Սուրբ Աստվավածին եկեղեցու տանիքում տարիներ առաջ կատարված վերակառուցման աշխատանքները վատթարացրել են ճեմարանի տանիքի վիճակը:Հիմա հազարավոր զբոսաշրջիկներ համալիրի այս անկյունը տեսնում են խոնավ պատերով ու շարունակ կաթոցներով: Սանահինի վանական համալիրը, որն ընդգրկված է ՅՈւՆԵՍԿՕ–ի համաշխարհային ժառանգության ցանկում, բազմաթիվ փորձությունների միջով անցնելով է հասել մեր օրեր։
Դեռ 2010 թվականին մամուլն ահազանգեց Սանահինի վանական համալիրի գլխավոր եկեղեցու պատի փլուզման վտանգի մասին: Եվրոպացի մասնագետների ուսումնասիրություններից հետո Սանահինի վանական համալիրում գրեթե ամեն տարի ՝ փուլային եղանակով վերանորոգման աշխատանքներ մեկնարկեցին:Նախ եւ առաջ վերակառուցվեց Սուրբ Աստվավածին եկեղեցու գավիթը:
Վանական համալիրի տարածքում գտնվող Սուրբ Հարություն մատուռն ու Սուրբ Հակոբ եկեղեցին եւս վերանորոգվել են, դեռեւս անավարտ է Զաքարյանների ու Արղությանների դամբարանների վերանորոգումը: Սակայն Գրիգոր Մագիստրոս ճեմարանի տանիքի նորոգման մասին առայժմ որեւէ ծրագիր չկա: