Խորհրդարանական ճեպազրույցների ժամանակ Էդուարդ Աղաջանյանը, անդրադառնալով լրագրողի այն հարցին, թե դուք մանդատ էիք ստացել նաև արցախահայության շահերը պաշտպանելու համար, բայց Արցախի խորհրդարանը երեկ հայտարարություն տարածեց, որ դուք չեք պաշտպանում արցախահայության շահերը. ինչպե՞ս կմեկնաբանեք այդ հայտարարությունը, Աղաջանյանը պատասխանեց. «Արցախահայության թիկունքում որևէ գործընթաց չկա և չի կարող լինել: Բնական է, որ այս գործընթացի կարևորագույն շահառուն հենց Արցախի ժողովուրդն է:
Ինչ վերաբերում է Արցախի խորհրդարանի հայտարարությանը, ես կարող եմ ասել, որ մեր գործընկերները լավ չեն ընկալել վարչապետի ելույթի բովանդակությունը, հակառակ պարագայում ես որևէ բացատրություն չեմ կարող գտնել այդ հայտարարության հիմքում։ Որևէ գործընթաց արցախցիների թիկունքում չի կարող լինել։ Այս ամբողջ գործընթացը միտված է արցախցիների իրավունքների պաշտպանությանը»: